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首先简单来说,IU/ml和copies/ml是没有直接关系的,IU/ml是国际标准物质的表述单位,copies/ml是各检测要领对结果的表述单位的一种,可拜见李金明《实时荧光PCR技术》P177。所谓的International Unit(IU),是为了统一各个检测要领而设定的单位。自己PCR检测的拷贝数是无法绝对定量的,可以理解为,为了统一标准,WHO制定标准物质,付与其IU值,发放给各个PCR试剂厂商,让他们把各自检测结果和标准物质比较,从而得出各自的换算系数。好比分发的是1IU的标准物质,罗氏测的是2copy,那罗氏的换算系数是2(2copies=1 IU),雅培的是20copy,那雅培的就是20(20copies=1 IU),由此可见,各个要领的转换系数是纷歧样的。其次,因为各实验要领检测结果的表述单位保存多样化,如copies/ml,geq/ml等,使得检测结果没有可比性,因而WHO应用国际单位IU作为统一的表述单位,使差别实验室、差别检测要领得出的检测结果的表述单位获得统一并具有了可比性。最后,具体每种要领的检测结果与IU的关系,可以通过同时检测WHO的标准物质,然后凭据其与标准物质的比例关系,来找到差别检测要领IU与copies之间的关系。
接纳Levey-Jerming质控图, 以X±2SD警告线,X±3SD为失控线。质控点落在x±3S之外时,首先接纳的步伐是复检,复检的目的主要是用于查明人为误差,也可以查出偶然误差,如果是偶然误差,重测的结果应在允许规模内。同时还在视察标准曲线的生成情况,扩增效率的崎岖,曲线梯并是否良好,曲线形态是否标准,Ct值是否有飘移,还要结合临床标本的检测结果,是否有高值和低值,来区分是试剂造成的失控照旧操作不当、仪器故障或老化造成的失控。若临床标本测定结果的曲线标准,丈量值有高有低,同时检测的试剂空白及阴性质控均在控,很有可能是标准品质量有问题,如降解、更换试剂型号等情况爆发造成的。 关于连续7个质控点落在均值之一侧,若均未凌驾X±3s规模时,认为保存系统误差,但检测结果仍可发出;若连续7个质控点落在均值之一侧,并且质控数据有凌驾X±3s规模的趋势时(逐渐升高或逐渐降低),一定要联络仪器工程师,实时校准仪器。
(1)实验室整体结构:凭据卫生部宣布的《临床基因扩增检验实验室治理暂行步伐》(卫医发[2002]10号)要求,临床基因扩增检验室原则上分为四个单独的事情区域:试剂贮存和准备区,标本制备区,扩增区,产品剖析区,也可以将后两个区域合为一个区,即扩增及产品剖析区。实验室设计时凭据《步伐》划定,三个区域相互独立,并有各自的缓冲区域。
(2)各事情区域仪器设备各事情区域的仪器设备及物品,包括椅子、办公用品、清洁用品等均不可拿出本区域,所有可移动物品均应有本区域的标示。
各区域应具备的设备配置为:屋顶紫外灯、近台紫外灯、一次性手套、一次性鞋套、事情服、废液缸、扫帚、拖把、废纸篓、微量加样器(笼罩1-1000ul),经高压处理的离心管和加样器吸头(带滤芯)、笔、纸等。各事情区域的特殊配置包括:
(1)试剂贮存和准备区:2~8℃冰箱、漩涡震荡器、超净事情台。
(2)标本制备:2~8℃冰箱、-20℃冰箱、高速台式冷冻离心机、漩涡震荡器、金属加热�?椤⒊皇虑樘�。
(3)扩增及产品剖析区:荧光定量核酸扩增仪、电脑、打印机。
同时:进入各事情区域必须严格凭据简单流向,并用明显的箭头体现,各区域用差别的颜色以示区别。即试剂贮存和设备区(蓝色)→标本制备区(白色)→扩增及产品剖析区(粉色)。
1、仪器使用的广泛水平
如果不是一个新泛起的仪器品牌,为包管所购置的仪器有充分的可靠性,临床PCR实验室可以从相应仪器在海内外使用的广泛水平来判断。应用越是广泛的仪器,越是经过实践验证的,也就越具有可靠性。
2、仪器的检测通量(反应孔数)
在购置定量PCR仪的时候需要凭据实验室的要求来选择差别通量的仪器。目前市面上的荧光定量PCR仪的检测通量小到16多到384孔,实验室可以凭据自己的检测项目和生长状况,选择合适的仪器,没须要追求最腾贵的仪器,一般来说,96孔的通量足够用了;如需寻找新药靶点和疾病标记等类型的实验,则可以考虑购置384孔的仪器。
3、仪器的通道数量
随着医院开展的项目越来越多,好比基因表达,单核苷酸多态性剖析、高区分率熔解曲线等,那么单通道的仪器则无法满足实验室的需求了,而多通道的设计则能使其更便当地检测多重PCR检测及其衍生的基因表达等其他剖析模式。
4、耗材的开放性
耗材如扩增反应管的开放性可能会决定日常检测本钱的崎岖。作为临床PCR实验室,在选择实时荧光PCR仪时,可考虑这一点。不过关于检测HCV等RNA项目的时候,尽量使用去RNAnase酶耗材。
5、硬件设计特点
荧光定量PCR仪主要有96孔板式和离心式等,每种设计都有它的独到之处,但也都有无法制止的缺陷。
96孔板的荧光定量PCR仪可以容纳的样本量大,最大可至100ul,并且无需特殊的耗材。古板的96孔板仪器多接纳卤钨灯引发、CCD检测。其优点在于:卤钨灯的光强比LED灯强,波长规模广,关于荧光染料的引发具有很是好的效果,性能比较稳定,使用寿命约3000个小时左右;但CCD的检测通�;嵋蛭扛鲅房拙喙庠春图觳馄鞯墓獬谈鞑幌嗤�,会爆发边沿效应,对结果爆发一定的影响。为了包管精确、精准的实验结果,这类仪器在实验历程中通常需要配合ROX校正染料,来平衡孔间差别;离心式的仪器通常选用LED引发、PMT检测,设计上制止了边沿效应,同时PMT检测对荧光信号可以放大或缩小,相关于CCD检测越发灵活,灵敏度更高;但LED的荧光强度比较弱,波长规模也比较窄,因此,对荧光染料的引发效果不如卤钨灯;
6、运行速度
在荧光定量PCR仪的众多技术参数中,升降温速度也是很是重要的。更快的升降温,可以缩短反应进行的时间,并且缩短了可能的非特异性结合和反应时间,提高PCR的特异性。可是,运行速度越快,对加热制冷�?榈囊笤礁�,因此,稳定性是其保存的最大问题,如果在市面上经过恒久考证的,稳定性好的仪器,运行速度越快,带来的便捷越多;
7、灵活性
在仪器基天性能获得包管的情况下,另外一方面则需要考虑仪器的灵活性,主要包括:仪器运输的灵活性,拆卸的灵活性,软件升级的灵活性,�?楦坏牧榛钚砸约笆褂玫牧榛钚缘�。
现在临床PCR实验室使用的试剂大部分都是各生产企业提供的商品化的试剂盒,那么试剂质量的优劣直接决定了实验结果的优劣,而差别厂家试剂的性能、质量和价格千差万别,如何选择一款合适的试剂对每个PCR实验室都至关重要,一般来说,选择试剂主要从以下几个方面进行评价:
1、重复性
首先,试剂检测结果的重复性直接展现了试剂的要领学及其质量的优劣,是评价试剂优劣最明显、最直接的指标。
其次,我们在此说的试剂重复性是指对原始样本检测的重复性,而不是对某一个样本提取的核酸进行重复性的检测和评价。
最后,试剂的重复性关于疗效检测、用药指导有着重大的意义,一个重复性好的试剂,往往能够在病人的抗病毒治疗历程中,给医生和病人提供最直接、最可靠的数据,让医生和病人对疾病进展有更清楚的认识,从而制定合理的治疗计划,实现更好的治疗效果。
2、灵敏度
一个试剂的灵敏度往往能够体现该试剂的技术水平和先进水平,同时关于临床病症的监测有着举足轻重的意义。以乙肝为例来说,我国的乙肝复发率远远大于兴旺国家,同时由乙肝病毒熏染转换为慢性肝炎、肝硬化、肝癌的患者也居世界前列,这很洪流平上与对低载量病毒监控的严重缺乏有关。美国肝病学会专家组就提出,对乙肝抗病毒治疗历程中,HBV DNA的最低监测点应设置为10IU/ml,而欧洲和亚太肝病学也指出HBV DNA病毒载量应该尽可能小于10IU/ml。这都足以证明,高灵敏度关于用药治疗、病程监控等起着巨大的作用,灵敏度越高,关于疾病的监控效果更好,关于确定治疗的终点,具有积极的指导作用。
3、定量准确性
关于临床检测中定量项目来说,试剂盒定量的准确性是很是重要的,也是评价定量试剂盒的一个重要指标之一。卫生部每年都会有2次全国性的室间质评,通过质评结果可以很好的看出试剂盒定量的准确性。 但往往许多时候,实验室在选择试剂的时候都偏重与已往的试剂盒比较定量结果的差别,并以已往的试剂盒定值作为标准来参考和评价一种新试剂,其拭魅这种要领不完全可取。不过可以通过同时检测卫生部的质控品来进行比较,这样才使得两种试剂在同一客观标准上进行PK,获得合理公正的评价。
同时,要验证一个试剂的定量是否准确,我们可以接纳一个高浓度样本,用阴性血清依次进行10倍梯度的稀释,然后选取多家试剂公司的产品进行同步检测PK,考察各公司试剂对样本定值的实际值与理论值的差别,即可判断各公司试剂定量准确与否。
4、有无内标监测
内标的一个最主要的作用就是控制假阴性结果的爆发,但在海内临床检测中往往被忽视了,这主要与两个方面有关,一个是之前海内使用的许多荧光定量PCR仪均为单通道的仪器,无法进行多色荧光的检测;海内外PCR行业对内标的研究已不是一个新兴课题,目前海内PCR行业能把内标做得很是好的科研单位或商业化的PCR试剂厂家寥寥无几,这正体现了这一技术的难度。
在临床检测中,内标的作用很是重要。在临床检测历程中,怎么做到每一个阴性结果均为真正的阴性结果,从而杜绝因扩增抑制而泛起的假阴性结果呢?内标的加入就能够很好的避免假阴性结果了,加入我们做了一个样本,它的目标检测荧光为阴性,内标检测荧光也为阴性,那么这个样本的扩增则受到了抑制,该阴性结果为假阴性,我们必须对该样本进行复检。如果试剂没有内标的话,我们则不可很好的判断该结果是否正常?是否可以发报告?在发报告时,我们无法包管发出去的结果百分之百的准确;内标的加入,就可以解决我们这方面的懊恼。目前,卫生部的专家也在大力推崇内标的重要性,也是为了包管检验结果的准确可靠。
5、线性定量规模
试剂盒的线性定量规模指的是试剂盒最低检测下限和最高检测上限之间的规模,规模越宽说明试剂盒性能越好。
6、UNG酶防污染体系
PCR反应历程中, 1个拷贝的DNA经过30个循环后,可以增长到10亿个拷贝的产品DNA, 极微量的PCR 产品污染,就可能造成假阳性,因而这是一个值得特别重视的问题。尿嘧啶糖苷酶(UNG)法:将PCR 产品中的dT用dU 取代。这种dU 化的PCR 产品与UNG 一起孵育,因UNG 可裂解尿嘧啶碱基和糖磷酸骨架间的N-糖基键,可除去dU 而阻止TaqDNA 聚合酶的延伸,从而失去被再扩增的能力。UNG 对不含dU 的模板无任何影响,UNG 可从单或双链DNA 中消除尿嘧啶,而对RNA 中的尿嘧啶和简单尿嘧啶分子则无任何作用。
别的,试剂的稳定性、批间差、溯源性(是否溯源于WHO国际标准品)等也都是考察一款试剂盒质量重要指标。
体外诊断试剂是指接纳免疫学、微生物学、分子生物学等原理或要领制备的、在体外用于对人类疾病的诊断、检测及流行病学视察等的诊断试剂,包括微生物抗原、人类基因检测、肿瘤标记物等等。我国对体外生物诊断试剂按药品进行治理,对体外化学及生化诊断试剂等其他类别的试剂则按医疗器械进行治理。这种分类治理的模式带来了一些问题:凭据《药品治理法》及药品 GMP 认证的要求,按药品进行治理的体外诊断试剂生产企业必须通过 GMP 认证。部分企业由于产值较低,企业生长规模有限,基础无力申报 GMP 认证。SFDA 医疗器械司助理巡视员常永亨介绍说,自 2005 年起, SFDA 就把体外诊断试剂监管看成一项重点来抓,正探索全新的治理模式,已经着手起草新的治理步伐,并在网上果真征求各界意见。此次邀请欧盟专家来华,也正是为了借鉴国际经验,做到科学监管,增进行业健康生长。据克里斯蒂 ? 塔瑞佳介绍,美国、加拿大等国和欧盟一直都将体外诊断试剂归入器械类治理。欧洲委员会于 1998 年 10 月 27 日 正式通过了 98/79/EC 体外诊断器械指令(简称 IVDD 指令),并通告于 1998 年 12 月 7 日 的第 L331 号欧盟公报上。凭据公报的内容,欧盟各成员国必须于 2000 年 6 月 7 日 之前完成执行本指令所需要的相关规则命令修制定与通告,自 2003 年 12 月起,所有在欧盟各成员国销售的体外诊断器械均须依照本指令完成切合性评价程序,贴上 CE 标记,才华在欧盟上市。凭据欧盟的 IVDD 指令,体外诊断试剂是作为一类特殊产品单独治理的,在该指令附录 Ⅱ 中,目录 A 和目录 B 上的品种因危害级别较高而治理相对严格。除此之外,欧盟对其他大部分危害级别较低的产品实行自我治理,即制造商建立质量治理体系,保存技术文件,做自我包管声明,通常无需政府批准即可上市。各国治理体外诊断试剂的具体规则虽略有差别,但概略上都是凭据危害治理的原则进行的,其对高危害的认定也比较一致,因为究竟差别于药品和医疗器械,其主要应用于体外,大部分体外诊断试剂是一种危害水平比较低的产品, 80% 左右的产品不属于高危害级别,因此欧盟的这种治理模式相对容易,治理本钱也低。